1. یکی از اصلیترین معایب ارتودنسی لینگوال، مشکلات در استفاده و قرارگیری آن است.
2. بهطور کلی، نیاز به تعداد جلسات بیشتر با دکتر در طول دوره درمان نسبت به ارتودنسی ثابت وجود دارد.
3. نصب براکتهای لینگوال به دلیل موقعیت داخل دهان کمی پیچیدگی دارد.
با این حال، با پیشرفت مداوم در طراحی سیستم لینگوال، این نقاط ضعف، خیلی کم به عنوان یک مشکل به حساب می آیند.